مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن wdhn۱۳ (lea) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
نویسندگان
چکیده
سابقه و هدف : پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی های عمومی ژن های lea به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می آید. روش های بیو انفورماتیکی روش های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن wdhn13 پروتئین های lea درگونه های مختلف گندم از 8 گندم زراعی و وحشی(شامل سرداری، نان گنبد، دوروم شوش، دورورم بروجرد، اورارتو، دیکوکوئیدز، تائوشی و اسپلتوئیدز) استفاده شد و توالی بدست آمده از آنها با تنها توالی ژن wdhn13 مربوط به گندم نان در پایگاه اطلاعاتی ncbi از طریق نرم افزار های بلاست، clc و داروین مقایسه شد یافته ها: نتایج آنالیز نشان داد که توالی ژن wdhn13 در گندم سرداری با توالی ژن wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در ncbi بیشترین شباهت و توالی ژن wdhn13 در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی ژن wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در ncbi دارد. علت این تفاوت هم تغییرات در اسید های آمینه بر اساس تغییرات در توالی dna نمونه ها می باشد. همردیفی از طریق نرم افزار blast و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم upgma نیز موید این نتیجه بودند. همچنین درخت فیلوژنتیکی رسم شده سیر تکاملی منطقی را در ارتباط با این ژن برای اشتقاق گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید از یکدیگر نشان داد. جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج blast و درخت فیلوژنتیک بر هم منطبق می باشند نتیجه گیری : نتایج این تحقیق نشان داد که با توجه به تکثیر ژن مورد نظر بر روی ژنوم های دیپلوئید اورارتو( aa ) و گونه های تتراپلوئید و هگزاپلوئید شامل ژنوم aa و عدم تکثیر برروی گونه های اسپلتوئیدز ( bb ) و تائوشی( dd ) می توان نتیجه گرفت که ژن wdhn13 بر روی ژنوم aa گندم قرار دارد.
منابع مشابه
مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
سابقه و هدف : پروتئینهای LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئینهای تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندیهای عمومی ژنهای LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست میآید. روشهای بیو انفورماتیکی روشهای مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی میباشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...
متن کاملمطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن موثر در مقاومت به خشکی wdhn13 lea) ) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
با توجه به اینکه خشکی یکی از معضلات کشاورزی امروز است و با توجه به اینکه گندم یکی از مهمترین محصولات زراعی است و بخش مهمی از زنجیره غذایی انسان را به خود اختصاص داده و همچنین اینکه سطح زیر کشت آن در کشور ما بالاست و کشور ما نیز در کمربند خشک و نیمه خشک قرار دارد، لذا مطالعات در زمینه مقاومت به خشکی حائز اهمیت است. با توجه به اینکه توالی ژن wdhn13 که یکی از ژن های مقاومت به خشکی بوده و باعث سنتز...
15 صفحه اولبررسی مقایسه ای توالی ژن موثر در واکنش به شوری (tasrg) در گندم های زراعی نان و دوروم و گونه های دهنده ژنومی آن ها
شوری یکی از بزرگترین عوامل محدودکننده رشد و عملکرد گیاهان زراعی از جمله گندم می¬باشد. با توجه به گسترده بودن مشکل شوری، مطالعات دقیق در زمینه درک و شناسایی ژن¬های درگیر در مکانیزم مقاومتی گیاهان در پاسخ به تنش شوری حائز اهمیت است. بررسی ها نشان داده است که ژن tasrg در تنش شوری موثر است. لذا در این تحقیق ژن tasrg در ده ژنوتیپ گندم(دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید) ردیابی و تغییرات آللی آن مورد ...
مطالعه بیوانفورماتیکی ژن Wdhn13 در گونههای دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش Insilco AFLP Analysis
سابقه و هدف: ژن Wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 LEA می باشد. پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های LEA شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئینهای LEA دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورما...
متن کاملمطالعه بیوانفورماتیکی ژن wdhn۱۳ در گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش insilco aflp analysis
سابقه و هدف: ژن wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 lea می باشد. پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های lea شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین های lea دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورما...
متن کاملشناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)
شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا میباشد، به طوری که سالانه میلیونها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاکهای زراعی میشود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین میکند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالییابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونههای زراعی و و...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی - مولکولیجلد ۳، شماره ۹، صفحات ۱۹-۲۷
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023